В университете реализуется многоступенчатая структура высшего профессионального образования:

• первая ступень – неполное высшее образование, получение которого позволяет продолжить образование на следующих ступенях;
• вторая ступень со сроком обучения не менее 4-х лет предусматривает получение академической степени бакалавра наук по избранному направлению. Все лица, получившие степень бакалавра наук, могут продолжить образование для получения квалификации или степени, соответствующей третьей ступени;
• третья ступень позволяет приобрести квалификацию инженера по избранной специальности или степень магистра наук по направлению.

Квалификация инженера по специальности может быть получена в системе подготовки без получения степени бакалавра.

Получая образование в соответствии с программой магистра, каждый обучающийся имеет право одновременно, выполнив требуемые задания и дипломный проект, получить диплом инженера.

В остальных случаях обучение, с целью получения диплома при наличии диплома об образовании третьей ступени, рассматривается как получение второго высшего образования и может осуществляться на платной основе.

Многовариантность способов получения высшего технического образования требует разработки четких норм и требований к выпускникам и образовательным программам.

МГУПП входит в ассоциацию технических университетов России и как технический университет предлагает широкий спектр программ подготовки специалистов:

• основные профессиональные образовательные программы (высшее профессиональное образование);
• сокращенная подготовка на базе профильного среднего профессионального образования (СПО);
• аспирантура и докторантура (послевузовское образование);
• повышение квалификации и переподготовка специалистов (дополнительное профессиональное образование);
• дополнительные профессионально ориентированные программы для студентов, которые могут реализовываться параллельно с основной образовательной программой (дополнительное образование).

Подготовка бакалавров в Университете проводится по 4 направлениям:

• Технология продуктов питания
• Технологические машины и оборудование
• Коммерция
• Защита окружающей среды
• Информатика и вычислительная техника

Подготовка дипломированных специалистов (инженеров, инженеров-экологов, инженеров-менеджеров, экономистов, экономистов-менеждеров, маркетологов, специалистов коммерции, информатиков, товароведов-экспертов) проводится по 29 специальностям и более, чем по 40 специализациям.

Подготовка магистров – по 14 направлениям и 10 программам

Формы обучения – очная, очно-заочная, заочная, дистанционная, экстернат.

Послевузовское образование:

• аспирантура – по 17 научным специальностям;
• докторантура – по 10 научным специальностям;
• количество диссертационных советов – 9.

МГУПП реализует широкий спектр программ дополнительного профессионального образования – профессиональную переподготовку и повышение квалификации по 15 аккредитованным образовательным программам.

С 1987 года на базе МГУПП  действует Учебно-методическое объединение по образованию в области технологии продуктов питания и пищевой инженерии Минобрнауки РФ (УМО ТППиПИ), в которое входит более 70 вузов России и стран СНГ (Председатель – ректор МГУПП, Еделев Дмитрий Аркадьевич, доктор медицинских наук, доктор экономических наук, профессор, академик РАЕН).

Расширение профиля подготовки специалистов для пищевой индустрии осуществляется за счет внедрения образовательных программ по комплексным межотраслевым направлениям научно-технического и социально-экономического прогресса, что позволяет удовлетворить в полной мере разносторонние потребности  научной и производственной сфер пищевого подкомплекса АПК на современном этапе.

Количество специальностей технического, технологического и экономического профиля увеличилось за последние 15 лет почти в 3 раза: до 1995 года их было 11, в настоящее время – около 40, количество специализаций – свыше 40.

Подготовка бакалавров осуществляется с 1992 года, подготовка магистров – с 1996 года.

Учитывая потребности пищевой индустрии, МГУПП выступил инициатором по включению в Перечень специальностей высшего профессионального образования России новых специальностей –  «Пищевая инженерия малых предприятий», «Технология продуктов детского и функционального питания», «Технология и дизайн упаковочного производства» и одним из первых начал обучение по ним.

В 2010 году лицензированы новые специальности и направления подготовки специалистов различных уровней образования:

• высшего профессионального образования по направлениям подготовки бакалавров 080700 «Бизнес-информатика», 080800 «Прикладная информатика», 100100 «Сервис», 200500 «Метрология, стандартизация и сертификация», 220600 «Инноватика» с нормативным сроком освоения по очной форме обучения 4 года на базе среднего (полного) общего образования;
• высшего профессионального образования по направлениям подготовки магистров 280200 «Защита окружающей среды», 220200 «Автоматизация и управление», 150400 «Технологические машины и оборудование» с нормативным сроком освоения по очной форме обучения 6 лет (через бакалавриат) на базе среднего (полного) общего образования;
• послевузовского профессионального образования (аспирантура) по специальностям научных работников 05.18.15 «Технология и товароведение пищевых продуктов и функционального и специализированного назначения и общественного питания», 05.18.05 «Технология сахара и сахаристых продуктов, чая, табака и субтропических культур», 05.18.07 «Биотехнология пищевых продуктов и биологических активных веществ», 03.01.04 «Биохимия», 08.00.05 «Экономика и управление народным хозяйством (по отрасоям и сферам деятельности) с нормативным сроком освоения по очной форме обучения 3 года на базе высшего профессионального образования;
• дополнительного профессионального образования с отрывом, частичным отрывом и без отрыва от работы  повышения квалификации по программе «Обучение иностранному языку (немецкий, английский, французский)» со сроком освоения от 72 до 500 часов на базе высшего и среднего профессионального образования; по программе «Мастер делового администрирования – Master of Business Administration» со сроком освоения 2 года;
• профессиональной переподготовки по программе «Профессионально-ориентированный иностранный язык» со сроком освоения свыше 500 часов  на базе высшего и среднего профессионального образования; по программе подготовки (переподготовки) водителей автотранспортных средств категории «В» со сроком освоения 2,5 месяца.

Планируются к открытию магистерские программы по направлениям:

• «Процессы и аппараты пищевых производств»

В центре внимания учебной деятельности Университета на протяжении последних лет – удовлетворение личности в получении такого образования, которое отвечало бы и ее актуальным и перспективным потребностям, и требованиям рынка труда, интересам общества, науки и производства.

С учетом этого проводится расширение спектра специальностей и направлений, программ «элитной» подготовки для наиболее одаренных студентов, дополнительных профессиональных программ (с получением сертификата или диплома о дополнительной квалификации), комплексных целевых программ, особенностью которых является индивидуальная траектория обучения с учетом специфики заказчика, а также «встроенное» обучение, учебно-производственная практика и стажировки в ведщих зарубежных университетах и фирмах. Реализация этих программ осуществляется через Центр элитной подготовки и содействия трудоустройству выпускников МГУПП.

Осуществляется работа по прогнозированию потребности в специалистах того или иного профиля подготовки.

Основной специфической чертой деятельности МГУПП традиционно является не только реализация существующих образовательных программ определенного типа, но и самостоятельное формирование  профессиональных образовательных программ на базе выработанных целей образования.

МГУПП выступил инициатором, разработал и первым в России внедрил в образовательные программы подготовки инженеров-технологов для пищевой промышленности такие новые курсы как «Пищевая химия», «Безопасность сельскохозяйственного сырья и пищевых продуктов», «Пищевые и биологически активные добавки»; издал по этим курсам первые в России учебники. Безусловным признанием этой деятельности стало включение перечисленных курсов в качестве федерального компонента в государственные образовательные стандарты подготовки инженеров по специальностям пищевого профиля.

За последние годы учеными-педагогами МГУПП разработаны и внедрены в образовательные программы подготовки специалистов разного уровня свыше 70 новых курсов, в т.ч.:

• Общие принципы переработки сырья и основы технологии пищевых продуктов (со специальным разделом «Теория технологического потока»);
• Современная проблема науки в пищевых и перерабатывающих отраслях АПК;
• История и методология науки о пище;
• Химия пищевых гидроколлоидов;
• Химия пищевого белка;
• Промышленная экология;
• Ферменты в пищевой промышленности;
• Экологические аудирование промышленных объектов;
• Радиоактивные загрязнения пищевых продуктов и методы контроля;
• Реологические методы контроля качества сырья и готовой продукции;
• Современные методы анализа продовольственного сырья и продуктов питания;
• Тароупаковочные материалы и проблемы экологии;
• Надежность технических систем и техногенный риск;
• Теория горения и взрыва;
• Математическое моделирование в технических задачах;
• Оценка воздействия на окружающую среду;
• Экологический менеджмент;
• Оценка эффективности инновационных проектов;
• Русский язык и культура речи;
• Документная лингвистика;
• Деловая корреспонденция;
• Язык специальности;
• Формирование деловой компетенции;
• Этикет делового человека и многие другие.

Одним из достижений последнего десятилетия является реализация магистерских программ по направлению «Технология продуктов питания», разработаны и реализуются более 15 наукоемких спецкурсов, обеспечивающих подготовку выпускников-магистров как разработчиков и исследователей, способных разрабатывать новые принципы функционирования технологических систем от переработки сырья до выпуска готовой продукции, создавать новые продукты заданного состава и свойств, предлагать новые физические, физикохимические, коллоидные, биохимические и микробиологические процессы для их производства; обеспечивать научное обоснование эффективности их производства и т.д.

• Биокаталитические процессы в пищевых технологиях;
• Пищевая химия;
• Пищевые добавки и улучшители;
• Анализ и контроль пищевых производств;
• Биотехнология алкогольных, слабоалкогольных и безалкогольных напитков;
• Пищевая микробиология;
• Моделирование и оптимизация технологических процессов производства пищевых продуктов;
• Биохимия зерна, продуктов его переработки и комбикормов;
• Новые пищевые продукты для рационального и сбалансированного питания;
• Информационное и программное обеспечение автоматизированных систем

• концепция гуманитарной подготовки специалистов (всех профилей подготовки);
• концепция химического образования специалиста в области пищевых технологий;
• концепция фундаментализации и совершенствования практической профессиональной подготовки  (разработка и реализация программ и требований ко всем видам учебно-производственной практики; реализация программы создания учебно-производственных комплексов (УПК по основным процессам пищевых технологий и минипивзавод, учебно-научно-производственный центр на БКК «Звездный» и др.).

Организация учебного процесса направлена на тесную связь с научными исследованиями, проводимыми на кафедрах, поскольку именно широкое участие студентов в научной работе является для Университета наиболее адекватным и активным путем преодоления известного противоречия между массовым характером подготовки в вузе и потребностями развития у каждого обучаемого самостоятельности и инициативы, индивидуального профессионального почерка и творческих способностей.

Различные аспекты этой интеграции, имеющей существенное значение для повышения качества образования и конкурентоспособности выпускников в условиях рыночной экономики, ежегодно отражаются в докладах студентов на кафедральных и факультетских Днях науки, межвузовской научно-методической конференции и др.

Реализация программы интеграции науки и образования:

• непосредственное участие студентов в выполнении НИР под индивидуальным руководством опытных специалистов, что позволяет им приобрести необходимые навыки практической деятельности, развивать творческую инициативу, стимулировать заинтересованность в повышении своей квалификации и определении места в жизни;
• включение элементов НИР в общие лабораторные практикумы, курсовое и дипломное проектирование, выполнение индивидуальных заданий, в т.ч. НИРС и УИРС, работ реферативно – аналитического характера с последующим обсуждением на семинарах, студенческих учебно-научных конференциях, «круглых столах», и т.п.
• особо следует выделить НИР студентов в рамках магистерских программ и подготовки магистерской диссертации, которая является базой для будущего обучения в аспирантуре.
• с целью усиления исследовательской компоненты при реализации профессиональных образовательных программ создан учебно-научный центр МГУПП «Биохимия и биотехнология» в институте биохимии им. А.Н. Баха РАН, реализуется договор о сотрудничестве с институтом биохимической физики им. Н.М. Эммануэля РАН и др.

Важный аспект учебной деятельности университета – совершенствование технологий реализации содержания образования.

Наряду с традиционными образовательными технологиями все шире используются технологии, основанные на методах научно-технического творчества и современных информационных средствах (электронные учебники, мультимедиа системы, АРМ, САПР, АСНИ, банки и базы данных и др.), в т.ч. включающие обучение на основе игровых моделей, учебных дискуссий, экспертных систем, интеллектуальных тренажеров, контролирующих, обучающих, моделирующих и управляющих программ, а также систем обучения профессиональным навыкам и умениям.

Расширяется использование в учебных целях телекоммуникационных (сетевых) образовательных технологий, основанных на применении «Интернет», а также региональных, отраслевых и локальных сетей.

В Университете создана и реализуется система  качества образования, включающая в себя подсистему обеспечения качества образования и  подсистему управления качеством подготовки специалистов.

Разработан пакет документов и методические рекомендации по  реализации системы, включающие критерии, факторы и показатели деятельности подразделений университета в области обеспечения качества, программу деятельности МГУПП в системе обеспечения качества, требования к аналитическому отчету подразделений университета в области обеспечения качества подготовки специалистов, алгоритм принятия решений в системе управления качеством подготовки специалистов и др.

Эти документы определяют функциональные обязанности службы «Мониторинг качества образования» и экспертного совета вуза, осуществляющих анализ и оценку деятельности подразделений по обеспечению качества образования, а также функциональные обязанности руководителей различного уровня в системе обеспечения качества подготовки специалистов.

Дважды в течение 5 лет проводится конкурс среди кафедр и факультетов Университета в области обеспечения качества.